Institut Kesehatan Helvetia Pekanbaru berawal dari berdirinya Akademi Kebidanan Helvetia Pekanbaru berdasarkan Keputusan Menteri Pendidikan Nasional Republik Indonesia Nomor 132/D/O/2005 yang diselenggarakan oleh Yayasan Rumah Sakit Umum Helvetia. Yayasan Helvetia sendiri didirikan pada tahun 1988 dan telah beberapa kali mengalami perubahan legalitas serta kepengurusan sesuai ketentuan hukum yang berlaku. Pada tahun 2018, badan penyelenggara Akademi Kebidanan Helvetia Pekanbaru resmi berubah menjadi Yayasan Helvetia berdasarkan keputusan Kementerian Riset, Teknologi, dan Pendidikan Tinggi Republik Indonesia.
Pada tahun 2022, Yayasan Helvetia dan Yayasan Amanah Bungo sepakat melakukan penggabungan melalui program APPPTS Kemendikbudristek RI. Penggabungan tersebut menghasilkan penyatuan kedua institusi pendidikan menjadi Institut Kesehatan Helvetia Pekanbaru yang resmi disahkan berdasarkan Keputusan Menteri Pendidikan, Kebudayaan, Riset, dan Teknologi Republik Indonesia Nomor 833/E/O/2023 tanggal 19 Oktober 2023. Dengan Program Studi :
1. DIII Kebidanan (Baik Sekali)
2. DIII Kebidanan PSDKU (Baik Sekali)
3. S1 Gizi (Unggul)
4. S1 Administrasi Rumahsakit (Unggul)
5. S1 Administrasi Kesehatan (Terakreditasi)